历经300多天的每天24小时不间断的反复实验测试与分析优化,永利澳门6774cm全自动样本处理与核酸提取工作站现已“身经百战,百炼成钢”!接下来我们将以一系列实验专题持续放送它的硬核战力值报告——本期我们聚焦它的核酸所得率和灵敏度进行探究。
核酸提取的目的是为了最终的检测结果,即阴性或阳性,核酸提取的效果直接决定了最终检测的结果,如果设备提取效果差,所得核酸浓度不足以检测出来,可能出现“假阴性”。
为了尽量多的获得核酸,需要根据所使用的试剂,匹配出最优的核酸提取参数,在设备开发之初我们就将所有可能用到的参数设置成了开放性的,比如添加试剂的孔位、添加试剂的液量、核酸混匀的时间、核酸混匀的速度、等待时间、晾干时间、吸磁时间等等,通过大量的试验,我们确定了永利澳门6774cm三步法的参数。
真正的实验效果如何呢?是否真的足以取缔人工提取的工作呢?百闻不如一见,让实验数据给我们最安心的答案——
实验材料:
1:病毒液
配置6种不同浓度梯度的病毒液,最高浓度为2e6copies/mL,最低浓度为20copies/mL。依次10倍稀释,每个浓度梯度下设置3个采样管。
2:试剂
准备三种需要的试剂,分别为洗脱液、清洗液和磁珠混合液。三种溶液在仪器中摆放的顺序,从左向右依次是:洗脱液、磁珠混合液、清洗液。
3:耗材
一轮测试需要耗材:1000uL TIP头:1盒,100ml试剂槽:3个,96深孔板:4个,磁棒套:6个,PCR管:3个
准备实验:
插入磁棒套,放入深孔板,放入TIP头,将试剂加入试剂槽,放到相应位置,将PCR管放到对应位置,套垃圾袋;将样本管放到样本架上,插入第一排样本架。(先放耗材再放样本,若先放样本,更换新的手套后再放置耗材,防止因不当的手工操作导致的交叉污染)
对比手工提取:
将各组浓度的病毒液采用相同的提取试剂,按照说明书给定的操作说明进行手工提取,得到各组的核酸。
机器提取6个浓度梯度病毒核酸,PCR检测,三批试验中各组的扩增曲线:
对比检测:
将提纯的核酸与相同样本和试剂手工提取的核酸进行体系构建后放入pcr检测仪进行检测,对比检测结果。机器与手工提取可以达到相同的检测灵敏度,同时在每个浓度梯度条件下,机器与手工的Ct值之间的差异均不大于1。
实验结果:
以上3组数据平均数做标准曲线,R2=0.9963,各组数据,检测的Ct值与病毒浓度的对数值之间呈现较好的线性关系。
实验结论:
(1)机器与手工提取6个浓度梯度病毒核酸,pcr结果显示:两种提取方式的一致性较高,每个浓度梯度下,两种方式提取核酸检测结果Ct值相差均不大于1。
(2)机器与手工提取6个浓度梯度病毒的核酸,pcr结果显示:两者可以做到相同的灵敏度,检测下限均可以做到200 copies/mL。
(3)检测得到的Ct值与病毒稀释的梯度有明显的线性关系,说明提取得到核酸的量与病毒的真实浓度之间呈现正比例关系。进而说明机器提取核酸性能稳定,效果没有大幅的波动。